在日本战后被分割统治的另一个世界里，1996年夏，位于联合国统治下的北海道的神秘巨塔工程悄然开始了而在美国占领的本州，这个塔真正建设目的却无人知晓。 那塔是一座隔着轻津海峡也可以清楚看到的庞然大物。两个15岁的少年：藤泽浩纪和白川拓也，对它有着不知道是敬畏还是憧憬的奇妙感情。他们利用军需废品，在山上的废弃小站里组装了一架名为ヴェラシーラ的小飞机。两个男孩同时喜欢着班上的泽渡佐由理。无论是佐由理还是“塔”，对他们而言都是一种象征，现在无法触即，将来一定会接近的事物。 但是，佐由理在中学三年级时，突然得了原因不明的记忆障碍症，转学去了东京。在无可名状的虚脱感中，两个少年渐渐停止了对飞机的制造，走上了不同的道路。 在2001年的东京，已经是大学生的浩纪和拓也再次相会。得知佐由理依然身陷病中，常年沉睡。二人想要把她解救出来。在这个过程中，他们不知不觉的接近了“塔”和这个世界的本质，以及佐由理隐藏的秘密。他们三个人，还能不能回到那约定的地方呢……
