以成为神奇瑰宝大师为目标，小智（松本梨喷鼻 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇瑰宝在世界各地住手艰辛的肄业之旅，明天他们历经远程跋涉毕竟分开了风光秀美的米琪亚镇。在外地一对小兄妹的引见下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭受了极端风险的状况。环节时辰，掌管时候的迪亚鲁加和守御神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）辅佐了他们，能与神奇瑰宝心灵不异的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，发了然世界的神奇瑰宝行将复苏，它不只会使时空曲解杂乱，还将为世界带来祛除性的多难害…… 本片为神奇瑰宝系列第十二部影戏剧场版。
